一、加強農(nóng)業(yè)生態(tài)環(huán)境保護工作，承擔現(xiàn)代農(nóng)業(yè)發(fā)展規(guī)劃和農(nóng)業(yè)綠色發(fā)展有關工作，指導農(nóng)業(yè)農(nóng)村節(jié)能減排和現(xiàn)代綠色生態(tài)農(nóng)業(yè)發(fā)展。組織和指導改善農(nóng)村人居環(huán)境，統(tǒng)籌推進生態(tài)宜居美麗鄉(xiāng)村建設。
二、指導畜牧業(yè)調整優(yōu)化結構布局，推進規(guī)范化、標準化養(yǎng)殖和畜禽養(yǎng)殖廢棄物資源化利用。指導漁業(yè)產(chǎn)業(yè)結構、布局調整和標準化工作，指導漁業(yè)水域生態(tài)環(huán)境及水生野生動植物保護。監(jiān)督管理漁業(yè)、漁港和漁船，加快推進漁船更新改造。
三、負責耕地及永久基本農(nóng)田質量保護。協(xié)助開展農(nóng)產(chǎn)品產(chǎn)地土壤環(huán)境質量的調查、農(nóng)產(chǎn)品產(chǎn)地土壤污染事故的調查處理和應急管理，對土壤污染狀況調查表明污染物風險管控相關標準或產(chǎn)出的農(nóng)產(chǎn)品污染物含量超標的耕地，組織開展重點監(jiān)測和污染風險評估，組織建立耕地土壤環(huán)境質量分類檔案，指導受污染土壤的環(huán)境風險管控。
四、加強農(nóng)業(yè)投入品監(jiān)督管理，完善農(nóng)藥廢棄包裝物和廢棄農(nóng)膜回收體系。指導、推進農(nóng)作物秸稈綜合利用和病死動物無害化處理。指導農(nóng)村可再生能源開發(fā)利用、節(jié)能減排、農(nóng)業(yè)清潔生產(chǎn)和生態(tài)循環(huán)農(nóng)業(yè)建設。加強飲用水水源地農(nóng)藥化肥監(jiān)管，防治農(nóng)業(yè)面源對水質造成影響，結合土地利用調整情況促進飲用水源地保護區(qū)內農(nóng)業(yè)種植逐步退出。
五、負責農(nóng)業(yè)植物新品種保護，牽頭管理外來物種，指導農(nóng)業(yè)生物物種資源的保護與管理。
六、負責動物防疫以及與動物有關的實驗室及其實驗活動的生物安全監(jiān)督等工作。
七、推廣使用符合生態(tài)環(huán)境要求的農(nóng)用非道路移動機械，推動老舊農(nóng)業(yè)機械報廢更新工作，配合市生態(tài)環(huán)境局監(jiān)督檢查。
八、負責組織對突發(fā)生態(tài)環(huán)境事件造成的農(nóng)業(yè)、漁業(yè)資源破壞進行評估，配合開展相關生態(tài)修復。
九、落實中央和省環(huán)境保護督察交辦涉職能的生態(tài)環(huán)境保護案件。
